Berawal pada tahun 1974, ibu-ibu anggota Pimpinan Daerah Aisyiyah Pamekasan yang didukung oleh pemerintah setempat mendirikan sebuah BKIA (Balai Kesehatan Ibu dan Anak) Aisyiyah Pamekasan, oleh karena pada waktu itu tempat pelayanan kesehatan masih sedikit. Pada waktu itu BKIA dipimpin oleh seorang bidan di bawah Pimpinan Daerah Aisyiyah Pamekasan.

Seiring perkembangan jaan dan bertambahnya waktu, pada tahun 1997 BKIA Aisyiyah berubah statusnya menjadi BP - RB Siti Aisyah Pamekasan. Pelayanan yang diberikan pun bertambah, BP - RB Siti Aisyah Pamekasan dipimpin oleh seorang dokter umum dan dibawah Yayasan MKKM Pimpinan Daerah Muhammadiyah Pamekasan.

Agar dapat memberikan pelayanan yang maksimal dan bertambahnya tenaga kesehatan, sarana dan prasaran yang dimiliki oleh BP-RB Siti Aisyah, maka pada tahun 2010 BP-RB Siti Aisyah Pamekasan meningkatkan statusnya menjadi klinik Rawat Inap Pelayanan Medik dasar dengan izin no : 01/441.301/REGDIT/SIKRIP/V/2010.  Dan pada tahun 2015 berubah menjadi KLINIK PRATAMA SITI AISYAH dengan izin no : 440/136/432.412/2015 Pada tahun 2018 berubah menjadi KLINIK UTAMA SITI AISYAH dengan izin no : 440/002/432.316/2018.

Dengan semakin berkembangnya dan semakin dipercaya oleh masyarakat yang membutuhkan pelayanan kesehatan terutama di bidang persalinan dan kebidanan dan seringnya menjadi rujukan persalinan dan kasus-kasus kandungan terutama oleh para bidan dan kadang-kadang tenaga kesehatan lainnya, juga karena sudah adanya dokter spesialis terutama dokter spesialis kebidanan dan kandungan yaitu dr Tatik Sulistyorini, SpOG, maka pada bulan September 2020, kami mengusulkan kepada Penyelenggara dalam hal ini Ketua Majelis Penyelenggara Kesehatan Umum untuk meningkatkan jenis pelayanan yang semula menjadi RUMAH SAKIT IBU DAN ANAK "SITI AISYAH" PAMEKASAN.